Temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) in study of environmental samples: first experiences

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F70883521%3A28110%2F10%3A63510070" target="_blank" >RIV/70883521:28110/10:63510070 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) in study of environmental samples: first experiences

Popis výsledku v původním jazyce

TGGE is an efficient method which allows us to study both composition and dynamics of complex microbial communities without the necessity of cultivation. Sample´s total DNA isolation and consequent PCR amplification of desired gene´s fragment need to becarried out before the TGGE experiment. Such pretreatment provides us with the population of gene fragments of the identical length from virtually all the strains present in the sample, and differing in their exact sequences. The DNA sequence variation in obtained gene fragments is a base for subsequent TGGE separation and identification of particular bacterial strains. Currently an equivalent method called denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) is used more often usually performed on D-code instrument (Bio-rad). In our laboratory we try to adopt TGGE instrumented on TGGE-Maxi system (Biometra) where the procedure is different particularly in the gel preparation and some other parameters. The instrument nowadays is relatively ra

Název v anglickém jazyce

Temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) in study of environmental samples: first experiences

Popis výsledku anglicky

TGGE is an efficient method which allows us to study both composition and dynamics of complex microbial communities without the necessity of cultivation. Sample´s total DNA isolation and consequent PCR amplification of desired gene´s fragment need to becarried out before the TGGE experiment. Such pretreatment provides us with the population of gene fragments of the identical length from virtually all the strains present in the sample, and differing in their exact sequences. The DNA sequence variation in obtained gene fragments is a base for subsequent TGGE separation and identification of particular bacterial strains. Currently an equivalent method called denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) is used more often usually performed on D-code instrument (Bio-rad). In our laboratory we try to adopt TGGE instrumented on TGGE-Maxi system (Biometra) where the procedure is different particularly in the gel preparation and some other parameters. The instrument nowadays is relatively ra

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GAP108%2F10%2F0200" target="_blank" >GAP108/10/0200: Studium biodegradability polymerních materiálů kombinací pokročilých metodik</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

25. výročný kongres československej spoločnosti mikrobiologickej s medzinárodnou účasťou

ISBN

970-80-970477-8-8

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

—

Název nakladatele

Československá spoločnosť mikrobiologická

Místo vydání

Bratislava

Místo konání akce

Stará Lesná, Vysoké Tatry

Datum konání akce

1. 1. 2010

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—