Calculation of clusters of hydrated amino-acid conformers
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F86652036%3A_____%2F14%3A00451604" target="_blank" >RIV/86652036:_____/14:00451604 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.dnatco.org/atlas/cluster/" target="_blank" >http://www.dnatco.org/atlas/cluster/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Calculation of clusters of hydrated amino-acid conformers
Popis výsledku v původním jazyce
Program downoads specified set of structures from the Protein Data Bank (PDB), performs structure quality check, adds neighboring crystallographic cells, extracts water molecules in the vicinity of the selected protein chain, analyzes protein-water contacts, water-amino-acid-residue distance distributions and residue SASA distributions, and classifies and clusters residue conformations based on secondary structure and rotameric state.n n
Název v anglickém jazyce
Calculation of clusters of hydrated amino-acid conformers
Popis výsledku anglicky
Program downoads specified set of structures from the Protein Data Bank (PDB), performs structure quality check, adds neighboring crystallographic cells, extracts water molecules in the vicinity of the selected protein chain, analyzes protein-water contacts, water-amino-acid-residue distance distributions and residue SASA distributions, and classifies and clusters residue conformations based on secondary structure and rotameric state.n n
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
cluster.sh
Technické parametry
BASH script, licence GPL 3
Ekonomické parametry
typový projekt
IČO vlastníka výsledku
86652036
Název vlastníka
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.