Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Transcriptome and Proteome Analyses Reveal Stage-Specific DNA Damage Response in Embryos of Sturgeon (Acipenser ruthenus)

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F86652036%3A_____%2F22%3A00558972" target="_blank" >RIV/86652036:_____/22:00558972 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60076658:12520/22:43904524

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.mdpi.com/1422-0067/23/12/6392" target="_blank" >https://www.mdpi.com/1422-0067/23/12/6392</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/ijms23126392" target="_blank" >10.3390/ijms23126392</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Transcriptome and Proteome Analyses Reveal Stage-Specific DNA Damage Response in Embryos of Sturgeon (Acipenser ruthenus)

  • Popis výsledku v původním jazyce

    DNA damage during early life stages may have a negative effect on embryo development, inducing mortality and malformations that have long-lasting effects during adult life. Therefore, in the current study, we analyzed the effect of DNA damage induced by genotoxicants (camptothecin (CPT) and olaparib) at different stages of embryo development. The survival, DNA fragmentation, transcriptome, and proteome of the endangered sturgeon Acipenser ruthenus were analyzed. Sturgeons are non-model fish species that can provide new insights into the DNA damage response and embryo development. The transcriptomic and proteomic patterns changed significantly after exposure to genotoxicants in a stage-dependent manner. The results of this study indicate a correlation between phenotype formation and changes in transcriptomic and proteomic profiles. CPT and olaparib downregulated oxidative phosphorylation and metabolic pathways, and upregulated pathways involved in nucleotide excision repair, base excision repair, and homologous recombination. We observed the upregulated expression of zona pellucida sperm-binding proteins in all treatment groups, as well as the upregulation of several glycolytic enzymes. The analysis of gene expression revealed several markers of DNA damage response and adaptive stress response, which could be applied in toxicological studies on fish embryos. This study is the first complex analysis of the DNA damage response in endangered sturgeons.

  • Název v anglickém jazyce

    Transcriptome and Proteome Analyses Reveal Stage-Specific DNA Damage Response in Embryos of Sturgeon (Acipenser ruthenus)

  • Popis výsledku anglicky

    DNA damage during early life stages may have a negative effect on embryo development, inducing mortality and malformations that have long-lasting effects during adult life. Therefore, in the current study, we analyzed the effect of DNA damage induced by genotoxicants (camptothecin (CPT) and olaparib) at different stages of embryo development. The survival, DNA fragmentation, transcriptome, and proteome of the endangered sturgeon Acipenser ruthenus were analyzed. Sturgeons are non-model fish species that can provide new insights into the DNA damage response and embryo development. The transcriptomic and proteomic patterns changed significantly after exposure to genotoxicants in a stage-dependent manner. The results of this study indicate a correlation between phenotype formation and changes in transcriptomic and proteomic profiles. CPT and olaparib downregulated oxidative phosphorylation and metabolic pathways, and upregulated pathways involved in nucleotide excision repair, base excision repair, and homologous recombination. We observed the upregulated expression of zona pellucida sperm-binding proteins in all treatment groups, as well as the upregulation of several glycolytic enzymes. The analysis of gene expression revealed several markers of DNA damage response and adaptive stress response, which could be applied in toxicological studies on fish embryos. This study is the first complex analysis of the DNA damage response in endangered sturgeons.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Molecular Sciences

  • ISSN

    1422-0067

  • e-ISSN

    1422-0067

  • Svazek periodika

    23

  • Číslo periodika v rámci svazku

    12

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    19

  • Strana od-do

    6392

  • Kód UT WoS článku

    000818190700001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85131311670