Lokální struktury DNA a jejich role ve funkci mutantního proteinu p53 z lidských nádorů
Cíle projektu
Transkripční faktory regulují genovou expresi prostřednictvím sekvenčně specifické vazby na DNA a/nebo rozpoznání lokálních struktury DNA (křížových struktur, triplexů a kvadruplexů). Protein p53 je nejčastěji mutovaným transkripčním faktorem u lidských nádorových onemocnění. Wt-p53 se váže specificky na cílové sekvence DNA, ale rozpoznává také různé alternativní DNA struktury. Většina mutantních proteinů p53 vykazuje sníženou sekvenčně specifickou vazbu na DNA, ale některé získávají nové funkce („gain of function“). Rozdíly ve vazbě mutantních p53 na lokální struktury DNA nejsou dosud plně pochopeny. Budeme systematicky studovat vazbu běžných mutantních p53 na lokální struktury DNA, od biochemických charakteristik až po relativní transaktivační kapacitu a lokalizaci v buňkách, s cílem zjistit vazebné parametry mutantních p53 k lokálním DNA strukturám a biologické důsledky těchto interakcí. Výsledky těchto experimentů zlepší naše znalosti o „gain of function“ mutantního p53 a umožní širší pochopení toho, jak lokální struktury DNA ovlivňují interakce proteinů ve zdraví a nemoci.
Klíčová slova
p53 proteinp53 mutantsgene expressionprotein DNA interactiongain-of-function
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202200004
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
22-21903S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Local DNA structures and their role in mutant p53 protein function in human tumours
Anotace anglicky
Transcription factors regulate gene expression via sequence-specific DNA binding and/or recognition of local DNA structures (cruciforms, triplexes, quadruplexes). The p53 protein is the most frequently mutated transcription factor in human cancers. Wild-type p53 binds DNA sequence-specifically, but also recognizes various non-B DNA structures. Most missense p53 mutant proteins show reduced sequence-specific binding, but some of them have additional “gain of function” properties. Differences in mutant p53 binding to structured DNAs are poorly understood. We will systematically study binding of common mutant p53s to local DNA structures of various types from biochemical characteristics to relative transactivation capacities and in vivo localization to reveal binding parameters of the mutant p53 to the local alternative DNA structures and biological consequences of these interactions. The resulting knowledge will improve our understanding of mutant p53 “gain of function” and may provide a broader understanding of how structured DNAs influence protein interactions in health and disease.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30204 - Oncology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)FD - Onkologie a hematologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2022
Ukončení řešení
31. 12. 2024
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
29. 2. 2024
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
12. 3. 2025
Finance
Celkové uznané náklady
7 056 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
7 056 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
7 056 tis. Kč
Statní podpora
7 056 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Oncology
Doba řešení
01. 01. 2022 - 31. 12. 2024