DNA vytvářející triplexy a jejich interakce s proteiny p53

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 6 (SGA02006GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

204/06/P369

Název projektu anglicky

Triplex-forming DNA and its interactions with p53 proteins

Anotace anglicky

Structure-selective DNA recognition is an important characteristic of not only tumor suppressor protein p53 (wtp53), but also of its oncogenic mutant forms (mutp53). It is supposed that, besides its sequence, DNA conformation is crucial for p53-DNA interactions in cells. This project is aimed to investigation of interactions of both wtp53 and mutp53 with DNA containing sequences that adopt intramolecular triplex structures in superhelical DNA (scDNA). Interaction of p53 with DNA involving the triplex structures will be compared with earlier described p53 binding to DNA forming other local structures (e.g. DNA cruciforms). Several biochemical and molecular biological approaches will be applied. Particular attention will be aimed to the methodsdetectionof DNA-protein interaction and for probing triplex DNA structures in vitro and in vivo. Development and optimization of a new technique for studying p53 interactions with scDNAs, based on immobilization of the intramolecular triplex-containing

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Za pomocí metod elektroforetických, precipitačních a imunodetekce se nám podařilo dokázat, že jak standardní typ wtp53 tak jeho mutantní formy p53 rozpoznávají DNA tvořící triplexy. Byly studovány triplexy intramolekulární (typu T.A.T) v plasmidech obsah

Zahájení řešení

1. 1. 2006

Ukončení řešení

31. 12. 2008

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

25. 4. 2008

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP09-GA0-GP-U/03:3

Datum dodání záznamu

22. 1. 2015

Celkové uznané náklady

1 197 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 197 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč