Molecular evolution and functional analysis of components of plant telomeres and telomerases
Project goals
Telomeres are nucleoprotein structures protecting chromosome ends from degradation and fusions. Many organisms use telomerase, comprising telomere reverse transcriptase (TERT) and telomerase RNA (TR), to replenish ends of chromosomal DNA lost at replication. We found in Asparagales that species divergence is associated with the evolution of novel types of telomeres. In addition to group (i) plants (e.g. orchids) with typical plant telomeres based on [TTTAGGG]n motifs, the group (ii) plants (e.g.Asparagus) exists in which mutation(s) results in synthesis of human-like [TTAGGG]n telomeres. The last group (iii) plants (e.g. Allium) do not synthesize any known telomeric repeat and their telomerization strategy must be different. The variations thatoccur inthese related plants enable us to address key questions about telomere and telomerase evolution and function of components of telomeric machinery. Project objectives include 1) isolation and comparative analysis of TERT and TR telomerase
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
521/05/0055
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární evoluce a funkční analýza komponent rostlinných telomer a telomeráz
Annotation in Czech
Telomery jsou nukleoproteinové struktury, které chrání konce chromosomů před degradací a fúzemi. Mnoho organismů užívá telomerázu, obsahující telomerovou reversní transkriptázu (TERT) a telomerázovou RNA (TR), k syntéze konců chromosomální DNA zkrácenýchpři replikaci. Zjistili jsme, že u rostlin řádu Asparagales je druhová divergence spojená s evolucí nového typu telomer. Kromě skupiny rostlin (i) (např. orchideje) s typickými telomerami založenými na motivech [TTTAGGG]n existuje skupina (ii) (např. Asparagus), u níž v důsledku mutace(-í) dochází k syntéze telomer lidského typu [TTAGGG]n. Třetí skupina rostlin (iii) (např. Allium) nesyntetizuje žádné známé telomerové repetice a její telomerizační mechanismus je značně odlišný. Variace, které se vyskytují u těchto příbuzných rostlin umožňují řešit klíčové otázky o evoluci telomer a telomerázy a o funkci jednotlivých součástí telomerizačního systému. Cíle projektu zahrnují 1) izolaci a komparativní analýzu TR a TERT podjednotek telomeráz u druhů
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10610 - Biophysics
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project solution produced results in the field of structural analysis of plant telomeres and telomerases and namely on molecular causes of their evolutionary changes. Novel genes coding for catalytic telomerase subunit were isolated and characterised in
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
3,792 thou. CZK
Public financial support
3,792 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
3 792 CZK thou.
Public support
3 792 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2005 - 31. 12. 2007