Cizorodý genetický materiál v genomu Elymus repens a ostatních Triticeae: jeho charakteristika, původ a evoluční význam.

Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Hlavní účastníci
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
13-04454S

Název projektu anglicky
Foreign genetic material in Elymus repens and other Triticeae grasses: its nature, origin, and evolutionary implications.
Anotace anglicky
Recently, we discovered the unexpected presence of foreign genetic material in the nuclear genome of the allohexaploid grass Elymus repens (Pooideae-Triticeae) and some other Triticeae. Some ITS ribotypes as well as a small chromosomal segment corresponded to Panicum, a member of a different grass subfamily (Panicoideae-Paniceae). Their presence might be due to ancient introgression or horizontal gene transfer, or a combination of both. We plan to investigate the presence, nature, origin and evolutionary significance of the foreign genetic material in the Triticeae using various molecular and cytogenetic approaches. The foreign DNA in selected Triticeae will be separated and analysed for the presence of functional genes that will be compared with their homologs from Panicum. The different ribotypes in E. repens and other Triticeae will be quantified (Real-Time PCR) at the DNA and RNA level to study their functionality, dynamics, and expression patterns. The project will have a large impact on the understanding of processes and mechanisms occurring in plant genomes.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EF - Botanika
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt přinesl informace o přenosu jaderné DNA mezi fylogeneticky vzdálenými skupinami cévnatých rostlin. Přestože způsob přenosu nebyl poznán, výsledky ukázaly, že recipientní genomy mohou integrovat a po dlouhou dobu uchovávat diverzitu a množství cizorodé DNA. Byly zavedeny postupy a metody k detekci a charakterizaci cizorodé DNA.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2017

Podobné projekty(10)