Vliv prostředí na evoluci genomové architektury rostlin v lokálním a regionálním měřítku

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 18 (SGA0201400001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

14-30313S

Název projektu anglicky

Environmental constraints on the evolution of plant genome architecture – regional and community scales perspectives

Anotace anglicky

In the project we aim to produce simple genomic data (monoploid genome size, genomic GC content and ploidy level) for complete vascular plant flora of the Czech Republic (> 2000 species). These data will be compared with available data on plant traits and their environments using phylogeny comparative methods. Contrary to previous studies, we aim to work with environments delimited with local species communities and by species pools of regional habitats. This will enable us to consider effect of species interactions and of different spatial scales. We hope that our project significantly improves understanding the role of the environment in shaping evolution of plant genomes as well as understanding the role of plant genome architecture in determining species’ ecology. The main objectives are (i) to detect and to estimate role of the environment in the evolution of plant genomes and by selection of species with different genomic architecture, (ii) to detect functional traits through that this selection operates and (iii) to find environmental factors that are forcing this selection.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EF - Botanika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt shromáždil informace o vlastnostech genomu (velikost, obsah GC) pro více než 1500 druhů cévnatých rostlin, což představuje většinu druhů flory České republiky, a zrekonstruoval jejich fylogenezi pro rigorózní analýzu vlivu prostředí na evoluci genomu. Mimo jiné byla objevena polyploidie Ginkgo biloba. Výsledky byly publikovány jako tři vědecké články a byly prezentovány na konferencích.

Zahájení řešení

1. 1. 2014

Ukončení řešení

23. 4. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 6. 2019

Celkové uznané náklady

7 889 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 889 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč