Struktura a synergie fibrolytických enzymů v bachoru

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-12431S

Název projektu anglicky

Structure and synergism of fibrolytic enzymes in the rumen

Anotace anglicky

The aim of the project is description of glycobiome and synergism of individual hydrolases of dominant G+ rumen hemicellulolytic species related to genera Butyrivibrio and Ruminococcus. Five isolates with exceptional hemicellulolytic activity are selected. The description will be based on NGS sequencing and assembling of genomes of all selected rumen isolates. Occurrence of hydrolytic enzymes and their interactions will be tested. Proteomic properties of xylanases, hemicellulases and cellulases in our isolates will be done with 2D elfo both denatured proteins and with zymogram detection of β-1,4-xylanases, β-1,4-endocellulases and minority hemicellulases with following MS analysis. The aim is to clarify the mechanism of fiber degradation in selected species and to describe unusual glycosyl hydrolases, their hydrolytic specificity with affiliation to GH families. Enzyme mixes will be selected for specific applications. Interactions of free hydrolases with cellulosome complexes will be tested. Protein structure will be proposed for selected enzymes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

GM - Potravinářství

CEP - další vedlejší obor

GH - Výživa hospodářských zvířat

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>21101 - Food and beverages<br>40201 - Animal and dairy science; (Animal biotechnology to be 4.4)<br>40202 - Pets

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

1. Nové poznatky o vlastnostech xylanolytických a celulolytických enzymů z vybraných bakteriálních kmenů. 2. Souhrn výsledků v závěrečné kartě je adekvátní. 3. Výsledky lze uplatnit i v jiných oborech, např. při ochraně životního prostředí (snížení produkce CH4 a CO2). 4. Tři publikace s impakt faktorem. 5. Bez nedostatkův dodržování pravidel.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

22. 7. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

4 284 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 032 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

252 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč