Alternativní sestřih jako regulátor auxinového transportu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-26428S

Název projektu anglicky

Alternative splicing as a regulator of auxin transport

Anotace anglicky

Alternative splicing provides an additional regulatory step in controlling gene expression. In the model plant Arabidopsis thaliana, there have been only few reports published showing the importance of alternative splicing in the context of plant morphogenesis and regulation of hormonal pathways. On the example of family of important hormonal regulators, we will demonstrate function alternative splicing as integrator of root development and hormonal response. Our preliminary data show that alternative splicing changes subcellular localization of these hormonal regulators. In our RNAseq data set from the root tip, we also found several novel non-annotated transcripts, and we collect the evidences that may have a relevant biological function. We also propose an innovative system for visualization of studied isoforms directly in the place where expressed. Finally, we propose a fast and efficient screen aiming at finding regulators of the splicing event studied.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení přineslo poznatky o úloze alternativního sestřihu transportérů auxinu z rodiny PIN proteinů v transportu auxinu a vývoji rostlin. Pozitivní je i výlučné zapojení doktoradnů, magisterských a bakalářských studentů do řešení projektu. Výstupem jsou 3 publikace v periodicích se spíše průměrným IF, jeden manuskript uložený na Biorxiv.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

11. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

5 711 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 711 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč