Genomická disekce bariér toku genů u hybridizujících kuněk

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-26714S

Název projektu anglicky

Genomic dissection of barriers to gene flow in hybridising fire-bellied toads

Anotace anglicky

The process of speciation involves the accumulation of genetic factors that reduce gene flow between differentiated populations and can be envisaged at the genomic level as the gradual spread of chromosomal regions that are barred from introgression. At present, we know little about the critical intermediate stage of the process between tentative beginnings and near-completion. The classic Bombina hybrid system promises unique insights into this part of the speciation continuum: despite ancient and profound ecological divergence, B. bombina and B. variegata continue to produce abundant fertile recombinants in narrow hybrid zones. We aim to generate a linkage map from newly created genetic markers and to annotate this map with estimates of introgression rates, QTL for adaptive traits and factors that reduce hybrid fitness. We will test theoretical predictions about efficient gene flow barriers and delineate the scope for ecological speciation in Bombina. More than 1000 DNA samples are available for analysis from experimental crosses and from the hybrid zone in Romania.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EG - Zoologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology

Hodnocení poskytovatelem

O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena

Zhodnocení výsledků projektu

Řešitelka v prodlouženém čase zvládla splnit hlavní cíle: 1. mapování genomu hybridizujíících kuněk metodou celogenomového sekvenování, 2. vývoj a obrana pulců. Projekt může přispět k obecnému chápání evolučního významu křížení příbuzných druhů. Zatím se však výsledky nepodařilo publikovat, existuje pouze jeden článek v recenzním řízení a druhý připomínkovaný spoluautory.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

11. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

6 080 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 080 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč