Objasnění životních strategií sladkovodních virů pomoci metagenomiky

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

Hlavní účastníci

Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-04828S

Název projektu anglicky

Unveiling life strategies of uncultivated viruses in freshwater environments using metagenomics

Anotace anglicky

Viruses are the most abundant biological entities on the planet, at least one order of magnitude more numerous than their host microbes in aquatic environments. Despite their abundance, studying viruses via cultured isolates remains challenging owing to the complexities in obtaining axenic cultures for the abundant microbial groups. The situation is even more acute for freshwaters where the availability of such pure cultures of the dominant phyla is still rather limited. We propose a long-term metagenomics based approach in two well-studied freshwater habitats to enable a first glimpse of the important double-stranded DNA bacteriophages in freshwaters. We will link these uncultured phages to their host both using existing sequence based approaches and also develop novel methods. In particular we will focus on life strategies of free-living viruses developed in the process of co-existence with the host microbes. Moreover, important insights into factors affecting seasonal dynamics of phage and host populations and global biogeography of freshwater phages are expected.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EH - Ekologie – společenstva

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

DA - Hydrologie a limnologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10501 - Hydrology<br>10502 - Oceanography<br>10503 - Water resources<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10617 - Marine biology, freshwater biology, limnology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt umožnil dříve nevídané vhledy do prokaryotických a virových komunit ve vodních nádržích, a výsledky byly publikovány ve vysoce prestižních vědeckých časopisech. Jedná se o vynikající projekt – velmi kvalitně řízený, zapojením mezinárodního kolektivu i studentů, a s vynikajícími výsledky.

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

4. 4. 2019

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

23. 7. 2020

Celkové uznané náklady

10 041 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 975 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

66 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč