Hon na hostitele bakteriofágů: nalézání hostitelů pro sladkovodní fágy

Název projektu anglicky
Phage host hunt: finding hosts for freshwater phages
Anotace anglicky
Phages (viruses infecting bacteria) are present in all ecosystems and structure microbial communities through the regulation of host populations and the release of host-bound nutrients through lysis. Metagenomics revealed a huge phage diversity in nature but often failed to assign hosts to phages. Especially in freshwater environments, this is partly due to the lack of cultured reference phages and their hosts. Recent advances in bacterial cultivation enabled the isolation of abundant freshwater bacteria (e.g., Fonsibacter, Methylopumilus) and we have a large culture collection of such strains. Here we propose to use these bacteria and established high throughput phage isolation protocols to isolate new phages and to bona-fide identify phage-host pairs. We will study the host range, natural abundances and dynamics of newly isolated phages. Finally, we will identify prophages in the genomes of isolates and by long-read metagenomics in environmental bacteria. Our proposed project hence plans to close an important gap in viral ecology by assigning hosts to phages.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EE - Mikrobiologie, virologie

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
19. 2. 2024

Podobné projekty(10)