Studium hetoromerických komplexů lipid kinázy PI4KB v roztoku

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

Hlavní účastníci

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-05200S

Název projektu anglicky

In-solution study of the lipid kinase PI4KB heteromeric protein complexes

Anotace anglicky

Large dynamic protein complexes cannot be studied by traditional protein crystallography due to their intrinsically disordered regions. Traditional NMR techniques are also not suitable due to their size. Phosphatidylinositol 4-kinase B (PI4KB), a kinase that generates phosphatidylinositol 4-phosphate (PI4P), a crucial molecule for the function of the Golgi forms several flexible protein heterocomplexes. It interacts with the small GTPase Rab11, with Golgi residing protein ACBD3 (Acyl-CoA binding domain containing 3) and with the scaffolding protein 14-3-3. Importantly, PI4KB is hijacked by viral protein 3A through the formation of a trimeric 3A:ACBD3:PI4KB protein complex. PI4KB is an essential enzyme regulated by various binding partners. The overarching goal of the proposal is to decipher the structural basis of PI4K regulation by their binding partners. We plan to employ small angle X-ray scattering (SAXS) and other biophysical methods to attain this goal.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Celkový záměr projektu a všechny dílčí cíle projektu byly naplněny. Byl objasněn vznik a struktura heterokomplexů kinázy PI4KB se svými regulačními partnery a virovým proteinem 3A. Výsledky jsou součástí 4 publikací v kvalitních impaktovaných časopisech.

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

10. 4. 2019

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

23. 7. 2020

Celkové uznané náklady

5 616 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 734 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

882 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč