Vše
Vše

Co hledáte?

Vše
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Prostorová organizace jádra mezidruhových kříženců rostlin

Cíle projektu

Chromozómy jsou v buněčném jádře lokalizovány v tzv. chromozomových teritoriích. Prostorová organizace těchto teritorií zřejmě není nahodilá. Chromozómy totiž vykazují mnoho kontaktních míst mezi geny a jejich regulačními oblastmi umístěnými v kratších či větších vzdálenostech na chromozómu nebo dokonce na různých chromozómech. Zdá se tedy, že prostorové uspořádání jádra hraje významnou úlohu v regulaci genové exprese. Současný vývoj konfokální mikroskopie s vysokým rozlišením a moderních genomických přístupů umožňuje detailní studium organizace jádra a chromozomových teritorií. Cílem navrhovaného projektu je charakterizace prostorové organizace jádra u mezidruhových kříženců a uspořádání chromatinu obou rodičů pomocí 3D-FISH. V projektu budeme hodnotit vliv poměru chromatinu obou rodičů na jejich uspořádání v jádře a zaměříme se rovněž na dynamiku uspořádání během buněčného cyklu. Navrhovaný projekt přispěje k našemu poznání organizace hybridních genomů a regulace jejich genové exprese.

Klíčová slova

interspecific hybridnuclear organizationchromatinchromosome domaingenome structureFestuca x LoliumTriticale

Veřejná podpora

  • Poskytovatel

    Grantová agentura České republiky

  • Program

    Standardní projekty

  • Veřejná soutěž

    Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

  • Hlavní účastníci

    Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

  • Druh soutěže

    VS - Veřejná soutěž

  • Číslo smlouvy

    17-13853S

Alternativní jazyk

  • Název projektu anglicky

    Nuclear architecture in interspecific plant hybrids

  • Anotace anglicky

    The plant cell nucleus is enclosed within the nuclear envelope harboring chromosome territories (CTs) and various nuclear bodies. It seems that the spatial organization of chromosomes is nonrandom and is characterized by many local and long-range contacts among genes and regulatory elements. Thus, it is evident that the architecture of interphase chromosomes plays a role in the regulation of gene expression. The introduction of sophisticated high-resolution microscopy and state-of-the-art genomics enables the complementary strategies to study CTs with high resolution. The aim of our project will be to characterize the spatial nuclear organization in interspecific hybrids and provides an insight into the positioning of chromatin from both parents using 3D-FISH. We will evaluate the effect of parental genomes proportion on their positioning within the nucleus and track the dynamics in the genome organization during the cell cycle. Our project will significantly increase our knowledge on the organization and function of hybrid genomes.

Vědní obory

  • Kategorie VaV

    ZV - Základní výzkum

  • CEP - hlavní obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • CEP - vedlejší obor

  • CEP - další vedlejší obor

  • OECD FORD - odpovídající obory
    (dle převodníku)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
    10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
    10605 - Developmental biology
    10608 - Biochemistry and molecular biology
    10609 - Biochemical research methods
    30101 - Human genetics

Hodnocení dokončeného projektu

  • Hodnocení poskytovatelem

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Zhodnocení výsledků projektu

    Projekt přinesl nové poznatky v oblasti studia organizace jádra a uspořádání chromosomových domén u mezidruhových hybridů (Lolium x Festuca and Triticum x Secale). Plánované cíle byly splněny, zpráva je přehledná. Výstupem jsou čtyři publikace. Finanční prostředky byly čerpány ve schválené struktuře a výši a byly vynaloženy účelně.

Termíny řešení

  • Zahájení řešení

    1. 1. 2017

  • Ukončení řešení

    31. 12. 2019

  • Poslední stav řešení

    U - Ukončený projekt

  • Poslední uvolnění podpory

    10. 4. 2019

Dodání dat do CEP

  • Důvěrnost údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Systémové označení dodávky dat

    CEP20-GA0-GA-U/02:1

  • Datum dodání záznamu

    23. 7. 2020

Finance

  • Celkové uznané náklady

    4 459 tis. Kč

  • Výše podpory ze státního rozpočtu

    3 430 tis. Kč

  • Ostatní veřejné zdroje financování

    1 029 tis. Kč

  • Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

    0 tis. Kč

Základní informace

Uznané náklady

4 459 tis. Kč

Statní podpora

3 430 tis. Kč

76%


Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

CEP

EB - Genetika a molekulární biologie

Doba řešení

01. 01. 2017 - 31. 12. 2019