Prostorová organizace jádra mezidruhových kříženců rostlin
Cíle projektu
Chromozómy jsou v buněčném jádře lokalizovány v tzv. chromozomových teritoriích. Prostorová organizace těchto teritorií zřejmě není nahodilá. Chromozómy totiž vykazují mnoho kontaktních míst mezi geny a jejich regulačními oblastmi umístěnými v kratších či větších vzdálenostech na chromozómu nebo dokonce na různých chromozómech. Zdá se tedy, že prostorové uspořádání jádra hraje významnou úlohu v regulaci genové exprese. Současný vývoj konfokální mikroskopie s vysokým rozlišením a moderních genomických přístupů umožňuje detailní studium organizace jádra a chromozomových teritorií. Cílem navrhovaného projektu je charakterizace prostorové organizace jádra u mezidruhových kříženců a uspořádání chromatinu obou rodičů pomocí 3D-FISH. V projektu budeme hodnotit vliv poměru chromatinu obou rodičů na jejich uspořádání v jádře a zaměříme se rovněž na dynamiku uspořádání během buněčného cyklu. Navrhovaný projekt přispěje k našemu poznání organizace hybridních genomů a regulace jejich genové exprese.
Klíčová slova
interspecific hybridnuclear organizationchromatinchromosome domaingenome structureFestuca x LoliumTriticale
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Hlavní účastníci
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-13853S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Nuclear architecture in interspecific plant hybrids
Anotace anglicky
The plant cell nucleus is enclosed within the nuclear envelope harboring chromosome territories (CTs) and various nuclear bodies. It seems that the spatial organization of chromosomes is nonrandom and is characterized by many local and long-range contacts among genes and regulatory elements. Thus, it is evident that the architecture of interphase chromosomes plays a role in the regulation of gene expression. The introduction of sophisticated high-resolution microscopy and state-of-the-art genomics enables the complementary strategies to study CTs with high resolution. The aim of our project will be to characterize the spatial nuclear organization in interspecific hybrids and provides an insight into the positioning of chromatin from both parents using 3D-FISH. We will evaluate the effect of parental genomes proportion on their positioning within the nucleus and track the dynamics in the genome organization during the cell cycle. Our project will significantly increase our knowledge on the organization and function of hybrid genomes.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt přinesl nové poznatky v oblasti studia organizace jádra a uspořádání chromosomových domén u mezidruhových hybridů (Lolium x Festuca and Triticum x Secale). Plánované cíle byly splněny, zpráva je přehledná. Výstupem jsou čtyři publikace. Finanční prostředky byly čerpány ve schválené struktuře a výši a byly vynaloženy účelně.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2017
Ukončení řešení
31. 12. 2019
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
10. 4. 2019
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Datum dodání záznamu
23. 7. 2020
Finance
Celkové uznané náklady
4 459 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 430 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 029 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
4 459 tis. Kč
Statní podpora
3 430 tis. Kč
76%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2017 - 31. 12. 2019