Úloha transposonů v dynamice rostlinných genomů

Název projektu anglicky
The role of transposable elements in the dynamics of plant genomes
Anotace anglicky
Transposable elements (TEs) are a significant part of the plant genomes but their evolutionary dynamics and influence on cell function is only beginning to be understood. In the proposed project, we will use bioinformatics and experiments to investigate various aspects of TE life in plant genomes – age, structural features, effect on recombination and genome size. In TEs, we will search for motifs (e.g. satellite DNA, microRNA, extraORFs, quadruplex DNA) that could regulate TE expansion and test our predictions through experiments. We will carry out experiments to test the effect of quadruplex DNA on TE expression, first in yeast and then in plant systems. We will engineer yeast LTR retrotransposons by inserting plant satellite DNA into them testing whether retrotransposons can spread satellite DNA in the yeast genome. Our results will contribute to understanding the structure, function and evolution of TEs. The ability to regulate TE activity can be further used to increase the genetic variability needed in breeding.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - vedlejší obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - další vedlejší obor
10611 - Plant sciences, botany
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EF - Botanika

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
22. 2. 2022

Podobné projekty(10)