Strukturální a biochemický vhled do nepřesného dekódování eukaryotickým ribozómem
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202000001
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-00579S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Structural and biochemical insights into miscoding by the eukaryotic ribosome.
Anotace anglicky
Recent studies revealed the involvement of glutamine tRNA in stop codon readthrough. Surprisingly, the efficiency of readthrough is not equal for all Glu-tRNA isoforms. The highest readthrough is manifested by the M isoform; i.e. the only isoform bearing the CUG anticodon. All other isoforms bear the UUG anticodon and their effects are negligible. Although the primary sequence of all Glu-tRNA isoforms differs only in a few nucleotides, our preliminary results revealed that the higher readthrough potential of the M isoform lies in its primary sequence. Here we primarily wish to investigate, both biochemically and structurally, what bases and what modifications of these bases contribute to the enhanced stabilization of the M isoform at the ribosomal A-site, which we believe stays behind its high readthrough propensity. In addition, we will examine a potential contribution of small ribosomal proteins constituting the A-site to the Glu-tRNA accommodation therein. Finally, we will investigate whether or not the gained knowledge is applicable to the remaining readthrough-inducing tRNAs.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EE - Mikrobiologie, virologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2020
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
8. 4. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
26. 6. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
8 154 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
8 154 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč