Studium dynamiky a termodynamiky komplexů myších feromonů s proteiny

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Dynamics and thermodynamics of mouse pheromone-protein complexes

Anotace anglicky

The project proposed here focuses on ligand-induced changes in dynamics of pheromone-binding proteins. Mouse MUP-I, previously studied by the joint applicant, was chosen as a protein model. Dynamic parameters describing amide bond motions will be estimated from relaxation data for the free protein and for MUP-I complexed with a native pheromone and pheromone analogs. Following introduction of advanced techniques of isotope labeling (alternating 13C labeling with partial deuteration), the dynamic measurements will be extended to side-chain C-H bonds. Effects of ligand binding on conformational entropy will be evaluated from values of the order parameter and compared with calorimetric data. Computational methods will be introduced to address otherfree energy changes upon ligand binding. Solution structures of free MUP-I and of its complex with the bound pheromone will be solved by NMR and compared with crystal structure obtained by a collaborating group. Application of the mentioned methodology t

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla vyvinuta nová metodika analýzy relaxačních dat pomocí studií teplotních závislostí redukovaných funkcí spektrální hustoty s využitím 15N 1H relaxačních dat v isotopicky značených proteinech. Jednalo se o velmi komplikovaná a časově náročná měření (m

Zahájení řešení

1. 1. 2000

Ukončení řešení

1. 1. 2002

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

4 290 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 875 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč