Vše
Vše

Co hledáte?

Vše
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Studium dynamiky a termodynamiky komplexů myších feromonů s proteiny

Cíle projektu

Navrhovaný projekt je zaměřen na studium změn dynamiky proteinů v důsledku vazby feromonů. Myší MUP-I, zkoumaný spolunavrhovatelem, byl vybrán jako modelový protein. Dynamické parametry popisující pohyby amidových vazeb budou stanoveny z relaxačních datpro volný protein a protein s navázaným feromonem a jeho analogy. Po zavedení pokročilých technik izotopového značení (značení 13C s částečnou deuterací) budou dynamická měření rozšířena na C-H vazby postranních řetězců. Vliv vazby ligandů na konformačníentropii bude stanoven z hodnot parametru uspořádání (order parameter) a srovnán s kalorimetrickými daty. Výpočetní metody budou využity k určení ostatních změn volné energie v důsledku vazby ligandů. Struktury volného MUP-I a komplexu MUP-I s navázanýmferomonem budou určeny pomocí NMR v roztoku a srovnány s krystalovými strukturami získanými v laboratoři spolunavrhovatele. Aplikace zmíněné metodologie na proteiny příbuzné MUP, které se podílí na transportu feromonů k jejich neuronovým receptorům, je

Klíčová slova

Veřejná podpora

  • Poskytovatel

    Grantová agentura České republiky

  • Program

    Standardní projekty

  • Veřejná soutěž

    Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

  • Hlavní účastníci

    Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

  • Druh soutěže

    VS - Veřejná soutěž

  • Číslo smlouvy

Alternativní jazyk

  • Název projektu anglicky

    Dynamics and thermodynamics of mouse pheromone-protein complexes

  • Anotace anglicky

    The project proposed here focuses on ligand-induced changes in dynamics of pheromone-binding proteins. Mouse MUP-I, previously studied by the joint applicant, was chosen as a protein model. Dynamic parameters describing amide bond motions will be estimated from relaxation data for the free protein and for MUP-I complexed with a native pheromone and pheromone analogs. Following introduction of advanced techniques of isotope labeling (alternating 13C labeling with partial deuteration), the dynamic measurements will be extended to side-chain C-H bonds. Effects of ligand binding on conformational entropy will be evaluated from values of the order parameter and compared with calorimetric data. Computational methods will be introduced to address otherfree energy changes upon ligand binding. Solution structures of free MUP-I and of its complex with the bound pheromone will be solved by NMR and compared with crystal structure obtained by a collaborating group. Application of the mentioned methodology t

Vědní obory

  • Kategorie VaV

  • CEP - hlavní obor

    CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

  • CEP - vedlejší obor

    CE - Biochemie

  • CEP - další vedlejší obor

  • OECD FORD - odpovídající obory
    (dle převodníku)

    10403 - Physical chemistry
    10608 - Biochemistry and molecular biology
    10609 - Biochemical research methods

Hodnocení dokončeného projektu

  • Hodnocení poskytovatelem

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Zhodnocení výsledků projektu

    Byla vyvinuta nová metodika analýzy relaxačních dat pomocí studií teplotních závislostí redukovaných funkcí spektrální hustoty s využitím 15N 1H relaxačních dat v isotopicky značených proteinech. Jednalo se o velmi komplikovaná a časově náročná měření (m

Termíny řešení

  • Zahájení řešení

    1. 1. 2000

  • Ukončení řešení

    1. 1. 2002

  • Poslední stav řešení

    U - Ukončený projekt

  • Poslední uvolnění podpory

Dodání dat do CEP

  • Důvěrnost údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Systémové označení dodávky dat

    CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7

  • Datum dodání záznamu

    19. 5. 2008

Finance

  • Celkové uznané náklady

    4 290 tis. Kč

  • Výše podpory ze státního rozpočtu

    2 875 tis. Kč

  • Ostatní veřejné zdroje financování

    0 tis. Kč

  • Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

    0 tis. Kč

Uznané náklady

4 290 tis. Kč

Statní podpora

2 875 tis. Kč

0%


Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

CEP

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

Doba řešení

01. 01. 2000 - 01. 01. 2002