Vliv ligandů na radiačně indukovaná poškození DNA
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
—
Hlavní účastníci
Ústav jaderné fyziky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
—
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Effects of drugs on radiation induced damages of DNA
Anotace anglicky
The project includes simulation of radiation attack on DNA complexes with ligands interacting by intercalation, minor or major groove binding. The suggested approach applies an original theoretical model which takes into account the effects of free radicals produced by the radioation in DNA surrounding. Our recently developed model is based on Monte Carlo simulation method (simulation of origin and diffusion of radicals) and Smoluchowski theory (chemical reactions of radicals with ligands and DNA).The three-dimensional atomic structures of DNA-ligand complexed used in simulations will be obtained from structure databanks (PDB, NDB) or will be calculated by the energy minimization of studied complexes (software SYBYL). Probabilities of radical attack tothe reaction sites of DNA and ligands will be calculated and compared to the structural parameters of complexes. The results will be analyzed in relation to radiation induced DNA damages.
Vědní obory
Kategorie VaV
—
CEP - hlavní obor
BO - Biofyzika
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Teoretický model RADACK byl upravaen a aplikován pro simulace nepřímého účinku ionizujícího záření na DNA interagující s různými ligandy. Konfrontací s experimentálními daty byl vysvětlen vliv struktury komplexů na výtěžky a distribuce poškození.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 1999
Ukončení řešení
1. 1. 2000
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2001/AV0/AV01IA/U/N/4:2
Datum dodání záznamu
—
Finance
Celkové uznané náklady
282 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
226 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč