Radiačně indukovaná poškození komplexů DNA s proteiny

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 1 (SAV0-AB2001)

Hlavní účastníci

Ústav jaderné fyziky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Radiation induced damage of DNA - protein complexes

Anotace anglicky

The project includes theoretical simulation of radiation attack to DNA-protein complexes. Our model allows predicting the effectsof OH radicals produced by radiation in molecules` surroundings. The model is based on Monte Carlo simulation method (originand radical diffusion) and Smoluchowski theory (radical reactions with DNA). We propose its extension for modelling radical reactions with proteins, the introduction of other radiolytic species and of the direct effect of radiation (ionizations and excitations of DNA and protein). The choice of DNA-protein complexes depends on:i) the availability of their molecular structures in databanks (PDB, NDB), ii) building by molecular modelling (software SYBYL) and iii) the availability of experimental yields ofradiation-induced damages. Probabilities of radical reactions with DNA and proteins will be analyzed in terms of molecular structure and radiation parameters with the aim to obtain yields of some types of primary biological damages.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

BO - Biofyzika

CEP - vedlejší obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Vyvinutá metodika pro predikci poškození biomolekul produkty radiolýzy byla použita pro komplexy lac operátoru s lac represorem a DNA oligomerů s Fpg a hOGG1 proteiny. Byl stanoven vliv interakce partnerů na výtěžky a rozdělení poškození.

Zahájení řešení

1. 1. 2001

Ukončení řešení

1. 1. 2003

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2004/AV0/AV04IA/U/N/3:2

Datum dodání záznamu

13. 10. 2004

Celkové uznané náklady

1 543 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

738 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

805 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč