Struktura, dynamika a funkce DNA

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Structure, dynamics and function of DNA

Anotace anglicky

The aim of this project is to understand structure, flexibility, dynamics and functions of nucleic acids (NA) at the atomic level. Wide range of state-of the-art computational methods will be utilized. Ab initio quantum chemical calculations will be usedto study the physical origin of relevant molecular interactions such as interactions of small DNA fragments with metal cations and intercalators. The ab initio calculations will be utilized for parametrization of empirical force fields and verification otheir limitations. Particle mesh Ewald molecular dynamics (PME MD) simulations of hydrated nucleic acids will be used to study the DNA molecules with a special attention paid to the following three areas: (i) Structure, dynamics and folding of unusual NAstructures, such as i-DNA and G-DNA, (ii) the effects of base sequence and unusual bases on the variability of double stranded DNA structures, (iii) interactions of DNA with intercalators and other drugs. Finally, flexibility of very long DNA fragments

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - vedlejší obor

CH - Jaderná a kvantová chemie, fotochemie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10402 - Inorganic and nuclear chemistry<br>10403 - Physical chemistry

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Odborný přínos projektu je nepochybný. Velmi vysoká publikační aktivita v prestižních mezinárodních časopisech. Hospodaření s finančními prostředky bylo po celou dobu trvání projektu v souladu s pravidly, až na přesun "cestovné" do "provozních nákladů" v

Zahájení řešení

1. 1. 2000

Ukončení řešení

1. 1. 2002

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

2 624 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 260 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 359 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč