Teoretické studium povrchů potenciální a volné energie párů bazí nukleových kyselin ve vakuu a vodní fázi metodami molekulární dynamiky

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Theoretical study of potential and free energy surfaces of DNA base pairs in vacuum and in water phase by means of molecular dynamics simulations

Anotace anglicky

The proposed project is dependent on a regular grant project "Structure and dynamics of DNA". One of the most important results of the main project is detailed knowledge: of the potential energy surface and vibrational dynamics of DNA base pairs at the ab initio level. This knowledge represents a very useful information, which creates a basis of our understanding of DNA structure. Ab initio methods, however, principally cannot give answers to all questions: they cannot yield structural information for large molecules than a few base pairs and the possibilities to use them to calculate statistical and thermodynamic properties (like free energy surface) are very limited. Molecular dynamics simulations, on the other hand, can successfully be used to calculate these characteristics. In the framework of the proposed project we want to use our knowledge of the ab initio potential energy surfaces to make the force fields used in molecular dynamics of DNA base pairs more accurate. The resulting more accu

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - vedlejší obor

CH - Jaderná a kvantová chemie, fotochemie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10402 - Inorganic and nuclear chemistry<br>10403 - Physical chemistry

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt přispěl k úspěšnému řešení nosného grantu garanta. Závěrečná karta obsahuje objektivní údaje o řešení projektu i o výsledcích. Výsledky byly publikovány v renomovaných časopisech (3 publikace) a na konferencích (4 prezentace). V současné době je

Zahájení řešení

1. 1. 1999

Ukončení řešení

1. 1. 2001

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3

Datum dodání záznamu

1. 4. 2003

Celkové uznané náklady

710 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

643 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

547 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč