Inhibice mutantů HIV proteázy - nový přístup v počítačovém návrhu inhibitorů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Inhibition of the HIV protease mutants - a new approach in the computer based drug design

Anotace anglicky

Treatment of HIV infection using novel virostatics-inhibitors of HIV protease (PR) is complicated by the appearance of PR mutants resistant towards numerous inhibitors. We postulate that the design of new generation of HIV-1 PR inhibitors should reflectthe following important considerations: i) Nor the inhibitor neither the substrate compete for binding site characterized by X-ray studies of the HIV-1 PR inhibitor complexes. They both compete for the binding site of the apoenzyme and this observation irelevant for broad spectrum of proteases. ii) Mutations can influence binding of the inhibitor directly and indirectly iii) The resistant mutant and the wild type active sites properties in apoenzyme differ significantly from these in closed conformationwhich are expected to be more similar, iiii) there is already a wealth of experimental data to be analyzed. The aim of this project is to develop a general new method for de novo design of inhibitors against proteases making a considerably large

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

CD - Makromolekulární chemie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry<br>10404 - Polymer science<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt vhodně spojoval výpočetní metody racionálního návrhu inhibitorů HIV-1 proteázy s experimentálně získanými kinetickými daty, charakterzujícími vazbu inhibitorů jak k mutantní tak standardní formě HIV-1 proteázy. Podařilo se zjistit, které struktur

Zahájení řešení

1. 1. 2000

Ukončení řešení

1. 1. 2002

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

2 289 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 955 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč