Struktura a dynamika bází, párů bází nukleových kyselin, oligonukleotidů a jejich komplexů s vodou, ionty a léčivy

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

203/05/0009

Název projektu anglicky

Structure and dynamics of DNA nitrogeneous bases, base pairs, oligonucleotides and their complexes with water, ions and drugs

Anotace anglicky

Structure and dynamics of nucleic acids are determined by molecular interactions and electronic properties of nucleic acid bases. In-depth analysis of the molecular interactions in nucleic acids will be carried out using a wide range of modern computational techniques. The highest quality quantum chemical approaches will characterise the electronic properties of nucleobases including their tautomeric eqiulibria, hydrogen bonding, base stacking and cation binding. However, the gas phase studiesthemselvesare not sufficient to understand the role of molecular interactions in DNA. To achieve this, the role of environment must be properly accounted for. Thus, nucleobases and their complexes will also be studied in polar environment using a variety of classical and quantum chemical approaches. In order to complete the research, molecular dynamics will be used to investigate the role of molecular interactions in DNA oligonucleotides and their complexes with drugs.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - vedlejší obor

BO - Biofyzika

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry<br>10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Nekovalentní interakce bazí nukleových kyselin a jejich vliv na strukturu, energetiku, dynamiku a vlastnosti DNA byly studovány pomocí širokého spektra metod výpočetní chemie. Párové interakce byly popsány nejpřesnějšími metodami kvantové chemie a tento

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

31. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 5. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-GA0-GA-U/04:3

Datum dodání záznamu

16. 12. 2008

Celkové uznané náklady

4 700 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 700 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč