Struktura a dynamika bází, párů bází nukleových kyselin, oligonukleotidů a jejich komplexů s vodou, ionty a léčivy
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
203/05/0009
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Structure and dynamics of DNA nitrogeneous bases, base pairs, oligonucleotides and their complexes with water, ions and drugs
Anotace anglicky
Structure and dynamics of nucleic acids are determined by molecular interactions and electronic properties of nucleic acid bases. In-depth analysis of the molecular interactions in nucleic acids will be carried out using a wide range of modern computational techniques. The highest quality quantum chemical approaches will characterise the electronic properties of nucleobases including their tautomeric eqiulibria, hydrogen bonding, base stacking and cation binding. However, the gas phase studiesthemselvesare not sufficient to understand the role of molecular interactions in DNA. To achieve this, the role of environment must be properly accounted for. Thus, nucleobases and their complexes will also be studied in polar environment using a variety of classical and quantum chemical approaches. In order to complete the research, molecular dynamics will be used to investigate the role of molecular interactions in DNA oligonucleotides and their complexes with drugs.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP - vedlejší obor
BO - Biofyzika
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10610 - Biophysics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Nekovalentní interakce bazí nukleových kyselin a jejich vliv na strukturu, energetiku, dynamiku a vlastnosti DNA byly studovány pomocí širokého spektra metod výpočetní chemie. Párové interakce byly popsány nejpřesnějšími metodami kvantové chemie a tento
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2005
Ukončení řešení
31. 12. 2007
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
2. 5. 2007
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Datum dodání záznamu
16. 12. 2008
Finance
Celkové uznané náklady
4 700 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
4 700 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč