Struktura a evoluce satelitní DNA rostlin
Cíle projektu
Vysoce repetitivní, tandemově uspořádané sekvence DNA (tzv. satelitní DNA) se vyskytují u většiny eukaryot a zaujímají značnou část jejich genomů. I přes toto rozšíření jsou však jednou z nejméně prozkoumaných složek genetické informace živočichů a rostlin, včetně modelových organizmů vybraných pro projekty sekvenování genomů. Právě oblasti obsahující satelitní DNA totiž tvoří většinu nedokončených úseků v genomových projektech, a to z důvodu jejich specifického uspořádání, které znesnadňuje analýzu konvenčními postupy. Tento projekt bude proto zaměřen na detailní analýzu několika modelových rodin satelitní DNA pomocí kombinace moderních molekulárních a cytogenetických metod, které by měly přinést nová data potřebná k objasnění prozatím neznámých mechanizmů evoluce satelitních repetic a jejich případné funkce v genomů.
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Sequence organization and evolution of plant satellite DNA
Anotace anglicky
Highly repetitive, tandemly organized DNA sequences (satellite DNAs) make up a considerable portion of most eukaryotic genomes. In spite of their abundance and widespread distribution, they represent one of the least studied components of complex genomes, including those of model organisms selected for the genome sequencing projects. In fact, most of the gaps in the almost completed sequences of these genomes correspond to satellite repeats, because these sequences are difficult to analyze using conventional approaches. Therefore, this project focuses on the analysis of long-range sequence organization of selected families of plant satellite repeats using advanced techniques integrating molecular and cytogenetic methodologies. The data generatedin these experiments should help to elucidate currently unknown mechanisms of highly dynamic evolution of satellite repeats and the eventual biological significance of this type of repetitive DNA.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Výsledkem řešení projektu jsou nové poznatky o sekvenční variabilitě satelitní DNA rostlin v rámci jednotlivých druhů i mezi druhy, které díky analýze velkého množství sekvencí umožnily komplexní popis populace studovaných repetic a sledování trendů jeji
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2004
Ukončení řešení
1. 1. 2006
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP07-GA0-GA-U/03:2
Datum dodání záznamu
16. 10. 2007
Finance
Celkové uznané náklady
5 471 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 585 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
2 830 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
5 471 tis. Kč
Statní podpora
3 585 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2004 - 01. 01. 2006