Extrachromozomální cirkulární DNA a její vliv na evoluci satelitní DNA rostlin

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 6 (SGA02006GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

204/06/P360

Název projektu anglicky

Extrachromosomal circular DNA and its impact on the evolution of plant satellite DNA

Anotace anglicky

Satellite DNA formed by long arrays of repetitive tandemly arranged nucleotide sequences makes up one of the most dynamic part of plant genome. It is highly variable in sequence and copy number in individual species, even closely related ones. However, the molecular mechanisms responsible for its amplification and deletion and forms, that can be the result of their action, are not known yet. Thus, new experimental data are required to shed light on these processes. According to the theoretical models homologous recombination between repetitive units leading to formation of circular satellite DNA could play an important role. Therefore, this project focuses on analysis of plant extrachromosomal circular DNA with special impact on detection and characterization of sequences homologous to satellite DNA. The analysis of circular satellite DNA will be performed in species with high proportion of repetitive DNA and highly amplified satellite DNA families using variable molecular techniques. The

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem naší práce bylo zjistit, zda jsou molekuly extrachromozomální kruhové DNA odvozené od satelitní DNA přítomny v genomech rostlin a systematicky zanalyzovat jejich výskyt pro široké spektrum druhů (patřících do rodů Arabidopsis, Oryza, Pisum, Secale,

Zahájení řešení

1. 1. 2006

Ukončení řešení

31. 12. 2008

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

25. 4. 2008

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP09-GA0-GP-U/03:3

Datum dodání záznamu

22. 1. 2015

Celkové uznané náklady

947 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

947 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč