Rozšíření analytických nástrojů pro strukturní hmotnostní spektrometrii
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202200004
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
22-27695S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Expanding the analytical toolbox for structural mass spectrometry
Anotace anglicky
Biological mass spectrometry has become an indispensable technique of integrative structural biology. It covers a very broad range of analytical methods of which the chemical cross-linking represents the most wide-spread one. Despite its popularity and ever-increasing number of users, the technique is reaching its limits mainly due to limited reliable chemistries targeting only some of the reactive groups in proteins. Within this proposal we will expand the cross-linker portfolio by generating a set of novel cross-linkers and adding new features to the existing ones. These modifications will include isotopic labeling and specific cleavable patterns facilitating cross-link identification in complex mixtures. Furthermore, we will establish analytical procedures suitable for cross-link product quantitation, describe the optimal fragmentation technique providing the best sequence information and will create a program for data interpretation. Finally, we will apply the developed approaches to biologically relevant protein targets.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - vedlejší obor
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - další vedlejší obor
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CB - Analytická chemie, separace<br>CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EI - Biotechnologie a bionika
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2022
Ukončení řešení
31. 12. 2024
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
29. 2. 2024
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
12. 3. 2025
Finance
Celkové uznané náklady
6 336 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 336 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč