Sekvenčně specifická elektrochemická detekce fragmentů genomové DNA amplifikovaných pomocí PCR

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 11 (SGA02011GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P206-11-P739

Název projektu anglicky

Sequence-specific electrochemical sensing of PCR-amplified genomic DNA fragments

Anotace anglicky

Several principles of electrochemical DNA sensing coupled to PCR amplification of specific DNA sequences were reported. Despite the apparently broad palette of techniques designed, there are still many questions to be answered before application of the electrochemical approaches in routine DNA sensing/diagnostic. This project is focused on testing various electrochemical detection protocols for analysis of ?real? genome DNA amplified with PCR. We will investigate methods involving (i) hybridization of an internal nucleotide sequence of a PCR product with DNA probes followed by label-free or label-based electrochemical detection or (ii) the incorporation of chemically modified nucleotides (markers producing specific electrochemical responses) into the PCR amplicons etc. We will select techniques exhibiting optimum analytical performance and apply them to meet typical diagnostic tasks - detection of point mutations/single nucleotide polymorphisms, analysis of the length of repetitive sequences or monitoring of gene expression.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CG - Elektrochemie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Výsledkem projektu je úspěšný vývoj protokolů amplifikace /detekce založených na použití elektroaktivních a enzymových značek. Druhá část projektu, návrh diagnostické techniky založené na PCR, byla řešena v limitovaném rozsahu kvůli mateřské dovolené ře?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

13. 4. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

6. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-GA0-GP-U/01:1

Datum dodání záznamu

6. 5. 2016

Celkové uznané náklady

1 376 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 376 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč