Transkriptomika na úrovni jednotlivých buněk jako nástroj pro studium subklonální heterogenity a klonálního vývoje u lymfomu z plášťových buněk
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202300001
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
23-05377S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Single-cell transcriptomics for the analysis of subclonal heterogeneity and clonal evolution of mantle cell lymphoma
Anotace anglicky
Mantle cell lymphoma (MCL) is a chronically relapsing malignancy. Molecular mechanisms associated with MCL relapse are still only partially understood. Lymphoma cell lines and patient-derived xenografts (PDX) represent important tools in preclinical research. Using single-cell RNA sequencing (scRNAseq) we will analyze paired longitudinal samples obtained from patients with newly diagnosed and relapsed MCL. Using the same approach (i.e., scRNAseq) we will compare the transcriptomes of newly established lymphoma cell lines and PDXs derived from one patient. New insights into molecular mechanisms associated with lymphoma relapse will be uncovered. New evidence on subclonal heterogeneity and relevance of lymphoma cell lines and PDX models in direct comparison to primary lymphoma samples will be obtained.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30205 - Hematology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
FD - Onkologie a hematologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2023
Ukončení řešení
31. 12. 2025
Poslední stav řešení
B - Běžící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
24. 4. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
19. 2. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
15 740 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
15 716 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
24 tis. Kč