Dispozice, výskyt a zpracování DNA lézí v genomu rostlin Arabidopsis thaliana defektních pro reparaci DNA a sestavování nukleozomů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202300001

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

23-06643S

Název projektu anglicky

Disposition, distribution, and processing of DNA lesions in the genome of Arabidopsis thaliana plants defective in DNA repair and nucleosome assembly

Anotace anglicky

A. thaliana plants lacking histone chaperone Chromatin assembly factor 1 (fas1 and fas2 mutants) show signs of genome instability such as accumulation of DNA lesions, the loss of repetitive elements, and tandem gene duplications. We have recently shown that loss of repeats is suppressed when ATM kinase is disrupted in fas1atm1 mutants. As ATM is a key regulatory kinase in the repair of double-stranded DNA breaks (DSBs), stimulating loss of repeats, it remains an open question how often DSBs emerge in fas1atm and if they represent the primary lesions accumulated in fas1. It is also not fully understood, how these lesions are processed in fas1 and fas1atm. In this project, we will employ DNA damage-seq approaches to determine the distribution of DNA lesions genome-wide and uncover the impact of individual DNA damage pathways in the processing of these lesions by in vivo microscopy. Using mutants with aberrant DNA damage processing we aim to explore, more broadly, key questions related to the stunning resilience of plant systems to external and internal genotoxic sources.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EF - Botanika

Zahájení řešení

1. 1. 2023

Ukončení řešení

31. 12. 2025

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 5. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

19. 2. 2024

Celkové uznané náklady

9 911 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 911 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč