Porozumění vazbě peptidový‎ch hormonů k jejich receptorům na atomární úrovni a návrh mimetik pomocí pokročilých vý‎počtů a experimentálního ověření

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202300001

Hlavní účastníci

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

23-06755S

Název projektu anglicky

Atomistic Understanding of Peptide Hormone Binding to Their Receptors and Mimetics Design via Advanced Computations and Experimental Verification

Anotace anglicky

Insulin and its analogs are life-saving molecules for diabetes patients. But due to their drawbacks, such as subcutaneous administration or low stability, the quest for non-peptidic small molecules, insulin mimetics, is urgent. Major breakthroughs in the cryo-EM methodology yielded several structures of insulin bound to its receptor (IR) at sufficient resolution (3.2 Å) for atomistic modeling and structure-based drug design. In this project, we will apply advanced methods of computational chemistry based on quantum mechanics (QM) and molecular dynamics (MD) to devise protocols for predictions of insulin/IR binding strength. They will be verified against experimental affinities and used to design insulin mimetics, synthesize them and measure their affinities to IR. For active compounds, their crystal structures will be determined and dynamical features beneficial for binding explored. Finally, this methodology will be extended to IR-B isoform, insulin-like growth factors and viral insulin-like peptides.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10403 - Physical chemistry

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

Zahájení řešení

1. 1. 2023

Ukončení řešení

31. 12. 2025

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 3. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

19. 2. 2024

Celkové uznané náklady

6 776 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 679 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

27 tis. Kč