Objasnění molekulárních mechanismů opravy příčných vazeb v DNA vázané na replikaci DNA

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202400001

Hlavní účastníci

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

24-12306S

Název projektu anglicky

Elucidating the molecular mechanisms of DNA crosslink repair by replication-coupled DNA repair

Anotace anglicky

Every day, tens of thousands of basic (Ap) sites are formed in every human cell. Ap site can spontaneously form covalent DNA interstrand crosslinks (Ap-ICLs). Generally, ICLs block replication and can lead to genomic instability, cell death, or cancer. Upon collision with the Ap-ICL, the helicase of replication machinery is ubiquitylated by TRAIP E3 ligase. NEIL3 glycosylase is then recruited via ubiquitin chains and its zinc finger domain (NZF) to repair the Ap-ICL allowing the replication to resume. Here, we will investigate the molecular mechanisms by which TRAIP facilitates replication-coupled ICL repair by identifying the ubiquitin linkage. We will determine the role of TRAIP patient mutations and their impact or dysregulation on ICL repair. We will also reveal the mechanisms of the recruitment of NEIL3 by NZF. Additionally, we will unravel the mechanism of NEIL3's specificity to bind single-stranded DNA yet repair crosslinks between two chains. We unravel the molecular architecture of the NEIL3 bound to crosslinked DNA and the reaction mechanisms of the Ap-ICL repair.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

10610 - Biophysics

OECD FORD - další vedlejší obor

30101 - Human genetics

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

BO - Biofyzika<br>CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2024

Ukončení řešení

31. 12. 2026

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 2. 2024

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

21. 2. 2025

Celkové uznané náklady

8 858 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 489 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

369 tis. Kč