Molekulární mechanismy podílející se na odstraňování R-smyček v místech interference mezi DNA transkripcí a replikací

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202500001

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

25-15542S

Název projektu anglicky

Molecular mechanisms involved in removing R-loops at sites of interference between DNA transcription and replication

Anotace anglicky

Transcription-replication conflicts caused by co-transcriptional RNA:DNA hybrids, known as R-loops, can lead to genomic instability, which is a driver of tumorigenesis. We discovered that replication forks blocked by R-loops can be reactivated through a process mediated by the MUS81 endonuclease, DNA ligase IV (LIG4), and the transcription elongation factor ELL. The goal of this project is to understand the molecular mechanisms responsible for removing R-loops at sites of R-loop-mediated fork stalling, which is necessary for replication restart via the MUS81-LIG4-ELL axis. Our recent studies have identified several proteins, including the DNA helicases FANCJ and RECQ5, the RNA/DNA helicases DDX17 and SETX, and the DNA topoisomerase IIIβ, as potential factors involved in this process. Here, we will investigate the functional interplay between these proteins at R-loops in human cells and in an in vitro reconstituted system. The results of this project will improve our understanding of the fundamental mechanisms that maintain genomic stability, thus preventing cancer.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

10601 - Cell biology

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EA - Morfologické obory a cytologie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2025

Ukončení řešení

31. 12. 2027

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

21. 2. 2025

Celkové uznané náklady

11 342 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

11 342 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč