Studium mechanismů reaktivace DNA replikace po kolizích mezi transkripčními a replikačními komplexy

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 23 (SGA0201900001)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

19-07674S

Název projektu anglicky

Exploring mechanisms of DNA replication restart upon collisions between transcription and replication complexes

Anotace anglicky

Transcription-replication collisions (TRCs) represent a significant source of genomic instability in cells experiencing DNA replication stress. Although there is a great deal of knowledge about the strategies that cells evolved to avoid TRCs, understanding of how a replication fork restarts DNA synthesis upon a TRC remains elusive. Our recent studies have shown that replication restart upon R-loop-mediated TRCs relies on MUS81 endonuclease, RAD52 single-strand annealing protein and DNA ligase 4 (LIG4). In this project, we aim to use a proteomic approach to identify and functionally characterize new factors involved in this process. Specifically, we will use the components of the MUS81 endonuclease complex, namely SLX4 and EME1, and the co-factor of LIG4, XRCC4, as targeting moieties for BioID-based proximity-dependent labeling of proteins at restarting replication forks, which will allow their isolation and identification by mass spectrometry. The candidate proteins will be subjected to functional analysis to decipher their roles in the reactivation of stalled replication forks.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2019

Ukončení řešení

31. 12. 2023

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

30. 4. 2021

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

22. 2. 2022

Celkové uznané náklady

10 396 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 563 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

833 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč