Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Mapping of the colicin route to the sensitive and immune bacterium: studies on colicin-receptor and colicin-immunity protein interaction

Anotace anglicky

Colicins are exocellular bacterial protein toxins produced by some bacterial strains of the family Enterobacteriaceae. Their highly efficient ability to kill sensitive bacteria is facilitated by highly specific interactions between colicin molecule andthe cell envelope proteins (and other components) of sensitive bacterium. Although colicins have been extensively studied in the past decades, little is known about the colicin recognition of outer membrane receptor and inhibition of colicin killingactivity by their cognate immunity proteins synthesized by producer bacteria. Here we propose to characterize the colicin-receptor and colicin-immunity protein interactions. We propose to use colicin U and OmpA protein as a model for colicin-receptorinteractions because of the significant advantages of this study system. The residues of OmpA protein involved in colicin U binding will be identified and the binding assays will be used to differentiate between binding and the ability to mediate the

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla zmapována interakční místa v proteinu OmpA, kolicinů U a Y a na imunitních proteinech kolicinů U a Y.Byly identifikovány 3 aminokyselinové zbytky v proteinu OmpA, které interagují s kolicinem U. Vedle I45 je dalším zásadním aminokyselinovým zbytkem,

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-GA0-GA-U/07:6

Datum dodání záznamu

15. 1. 2009

Celkové uznané náklady

2 857 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 857 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč