Genomová spojení u rostlin: od DNA ke chromosomům a zpět

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501-10-0208

Název projektu anglicky

Genome reunions in plants: from DNA to chromosomes and reverse

Anotace anglicky

Many, perhaps all flowering plant (angiosperm) species have undergone whole chromosome set multiplication in their ancestry. Often this is associated with interspecific hybridization, a process called allopolyploidy. In the heart of the proposed projectlies the central question of chromosome evolution following allopolyploidization when the diverged genomes become reunified in the nucleus. Large number of data generated by high-through put sequencing methods will enable us to determine which parts of genomes are evolving rapidly and which remain constant. We will explore the fate of the repeated DNA families, both tandems and dispersed, in allopolyploids of different ages. This will be informative since tandem repeats are involved in stabilizing chromosome structure and in homologue/heterologue recognition. Allopolyploidy provides us with a natural tool to determine how the repeats have evolved both within and between diploid and polyploid sections where it is likely that evolutionary pressures are different.  We will also investigate epigenetic factors (e.g. DNA methylation) apparently involved in stabilization of repeated DNA in cell nucleus. These directions are likely to increase our knowledge of genome behavior upon the polyploidy and may be exploited in assisted breeding programs and biotechnology.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

BO - Biofyzika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Závěrečná zpráva je pečlivě vypracována a obsahuje všechny náležitosti. Projekt byl řešen na vynikající úrovni a byly získány původní poznatky o dynamice změn rodičovských genomů u alopolyploidních druhů rostlin. Projekt přispěl k výchově doktorandů (3 ?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2012

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP13-GA0-GA-U/02:3

Datum dodání záznamu

17. 5. 2016

Celkové uznané náklady

2 973 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 973 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč