Význam repetitivních sekvencí pro strukturu, evoluci a funkci rostlinných centromer

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501-11-1843

Název projektu anglicky

Impact of repetitive sequences on structure, evolution and function of plant centromeres

Anotace anglicky

Centromere is one of the most important chromosome domains as it is essential for faithful chromosome segregation during cell division. Although the function of centromere is conserved in all eukaryotes, underlying DNA is surprisingly variable between species and its role in centromere determination and function is still poorly understood. Investigation of plant centromeres has been long hampered by the absence of genome sequence data from a broad spectrum of species and by the lack of suitable markers of functional centromere domain. Recent progress in next-generation sequencing technologies and discovery of centromere-specific proteins offer an unprecedented opportunity for detailed investigation of plant centromeres in species whose genomes have not been sequenced yet. The major goal of this project is to explore centromeres in pea (Pisum sativum) because they differ from those of current model species in several key aspects. Thus, their detailed investigation is going to give new insights to the understanding of relationship between plant centromere structure and function.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Tento projekt byly zaměřen na studium struktury a funce centromer rostlin z čeledi Fabaceae. Byly identifikovány geny kódující specifické centromerické histony CenH3 a zjištěna expanze centromerických sekvencí. Byly publikovány dvě excelentní práce (velmi rozsáhlé), které skvěle ilustrují kvalitu tohoto výzkumu (PLoS Genetics IF 8,5 a MBE IF 9,1).

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 3. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

25. 9. 2017

Celkové uznané náklady

7 210 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 210 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč