Repetitivní DNA a její význam pro strukturu a funkci rostlinného genomu

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

KONTAKT II

Veřejná soutěž

KONTAKT II 1 (SMSM2011LH1)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-6784/2013-311

Název projektu anglicky

The role of repetitive DNA in plant genome architecture and function

Anotace anglicky

Repetitive DNA, composed of diverse families of mobile elements and tandem repeats, makes up significant portions of most higher plant genomes. Despite the growing acknowledgment of the repetitive DNA as one of the major forces shaping plant genomes, there is relatively little known about molecular and evolutionary mechanisms of repetitive DNA turnover in plant genomes, and about specific functions it plays in genome architecture. In this project, we propose to employ a combination of advanced sequencing, bioinformatic and cytogenetic approaches to elucidate these problems by investigating repetitive DNA on various levels, including whole genomes, defined genome compartments, and specific families of repetitive DNA.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - další vedlejší obor

EF - Botanika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla provedena komparativní analýza složení repetitivní DNA u skupin druhů s malými (Musaceae) a středně velkými genomy (Fabeae). Dále byl dokončen výzkumu struktury a sekvenčního složení centromerických oblastí chromozómů u Solanaceae a Fabeae. Získané?

Zahájení řešení

1. 3. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

3. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-MSM-LH-U/01:1

Datum dodání záznamu

2. 7. 2015

Celkové uznané náklady

6 277 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 890 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 387 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč