Molekulární evoluce rodu Arsenophonus, symbiotických bakterií s širokým hostitelským spektrem

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P505-10-1401

Název projektu anglicky

Molecular evolution of Arsenophonus, an emerging group of symbiotic bacteria with a broad host distribution

Anotace anglicky

The project explores in a complex and systematic manner the phylogeny and evolution of rapidly growing group of insect-associated intracellular bacteria of the genus Arsenophonus. By combining methods of molecular phylogenetics, population genetics, comparative genomics, and molecular-markers-based method of visualisation (fluorescence in situ hybridisation ? FISH), it addresses the main questions that have arisen from the current fragmentary knowledge on the Arsenophonus evolution and its relation to the host. The aims of the project include 1) Multi-gene analyses of the phylogenetic patterns. This part of the project will focus on phylogenetic relationships among Arsenophonus lineages with different life strategies (i.e., parasites, commensals, mutualists) and screening for new lineages with respect to geography- and host-distribution. 2) Mapping of Arsenophonus distribution on the host?s genealogy with the aim to assess the coevolution vs. multiple-origin hypotheses. 3) Comparative genomics based on the new genome sequence from a model lineage of Arsenophonus. 4) FISH-based investigation of the symbiont location in the host tissues. 

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EH - Ekologie – společenstva

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

EG - Zoologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Odborná úroveň publikací je odrazem celkového IF, který u 4 publikací činil 48,9 bodů. Údaje v závěrečné kartě jsou adekvátní dosaženým výsledkům mohou být podkladem pro studium dalších mikrobiomů živočichů. Jediným zjištěným nedostatkem bylo velmi stru?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

1. 7. 2014

Celkové uznané náklady

5 451 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 451 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč