Vizuální analýza interakcí proteinů a ligandů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní projekty

Veřejná soutěž

Mezinárodní projekty 13 (SGA0201800003)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Fakulta informatiky

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

18-18647J

Název projektu anglicky

Visual Analysis of Protein-Ligand Interactions

Anotace anglicky

The visual analysis of protein structures has been researched in several projects within the past few years. It is necessary to focus on both interaction partners and to also take into account their physico-chemical properties in order to understand protein interactions. Thus, we plan to enable the visual analysis of protein-ligand interactions as captured in state-of-the-art simulations by focusing on these properties. The main goal is to make these time-dependent data sets better accessible for protein designers, and help them to develop adaptions that enable a more efficient interaction. In particular we will develop novel visualization techniques which convey the relevant properties by means of abstract representations as well as structural embeddings. We will enhance these techniques for a visual comparison of different interactions, which eventually enable us to develop domain-centered immersive visual analytics approaches. We will evaluate our methods together with domain experts in order to ensure their effectiveness for the visual analysis of protein-ligand interactions.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

20206 - Computer hardware and architecture

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

JC - Počítačový hardware a software

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Tento projekt se zabýval vizuální reprezentací molekulárních interakcí za účelem analýzy výstupů výpočetních modelů například pro vývoj léčiv, neboť zkoumat tato data klasickým způsobem by bylo pro experty příliš časově náročné. Výsledné metody jsou průběžně integrovány do softwarových nástrojů jako je Caver, aby tak byly k dispozici koncovým uživatelům.

Zahájení řešení

1. 1. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

25. 6. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GC-U/01:1

Datum dodání záznamu

29. 6. 2021

Celkové uznané náklady

2 982 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 270 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

742 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč