Vše
Vše

Co hledáte?

Vše
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Adsorpce proteinů na molekulových sítech: Ab initio modelování

Cíle projektu

Porozumění adsorpce proteinů na mezoporézních molekulových sítích (ordered mesoporous silica, OMS) je podstatné zejména z důvodu průmyslového využití (biokatalýza, léčiva, atd.). Teoretický popis těchto systémů je výzvou vzhledem k jejich komplikované struktuře. Popis na úrovni standardních silových polí nemusí být dostatečný a jejich přesnost nebyla pořádně ověřena. V tomto projektu navrhuji systematický přístup k popisu interakce mezi OMS materiály a proteiny. Základním výchozím bodem je velmi přesný ab initio popis modelových systémů, které slouží pro parametrizaci silového pole. Parametry silového pole jsou testovány (ověřeny) proti přesným výpočtům adsorpce malých peptidů na dobře definovaných mikroporézních materiálech. Rovněž je nutné porozumět roli solventu (voda) mezi OMS a proteiny. S výsledným silovým polem lze modelovat adsorpci proteinů na OMS materiálech s dostatečnou přesností, a tudíž získat obecné trendy, na jejichž základě je možné navrhovat nové a z hlediska adsorpce lepší mezoporézní materiály.

Klíčová slova

adsorptionmesoporous silicaproteinsab initio modelingforce-field parameterization

Veřejná podpora

  • Poskytovatel

    Grantová agentura České republiky

  • Program

    Postdoktorandské granty

  • Veřejná soutěž

    Postdoktorandské granty 15 (SGA0201400003)

  • Hlavní účastníci

    Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

  • Druh soutěže

    VS - Veřejná soutěž

  • Číslo smlouvy

    14-18521P

Alternativní jazyk

  • Název projektu anglicky

    Protein adsorption on molecular sieves: Ab initio modeling

  • Anotace anglicky

    The adsorption of proteins onto ordered mesoporous silica (OMS) is important due to the possible industrial applications as biocatalyst or drug delivery systems etc. The theoretical description of those materials is quite challenging task due to the complex structural features of both adsorbent (such as SBA-15) and adsorbate (protein). The common theoretical description of those host-guest systems is with force-fields, which accuracy has not been validated. A new systematic approach for the interactions between the OMS and protein interface is proposed. The strategy is based on highly accurate ab initio calculations of model systems to parameterize the force-field parameters and its validation is performed by means of adsorption of small peptides at well-defined microporous materials. The role of the solvent (water) on the interaction between OMS and proteins will be also addressed. The search for the interaction patterns between OMS and proteins should indicate some general features, which could be helpful in designing new OMS materials.

Vědní obory

  • Kategorie VaV

    ZV - Základní výzkum

  • CEP - hlavní obor

    CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

  • CEP - vedlejší obor

  • CEP - další vedlejší obor

  • OECD FORD - odpovídající obory
    (dle převodníku)

    10403 - Physical chemistry

Hodnocení dokončeného projektu

  • Hodnocení poskytovatelem

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Zhodnocení výsledků projektu

    Řešení projektu nebylo hladké a procházelo řadou obtíží, kdy se nedařilo získat očekávané výsledky. I přes roční odklad hodnocení projektu je jediným hodnotným výstupem tříletého projektu práce uveřejněná v časopise Comput. Theor. Chem. (2017), která se tématem projektu detailně zabývá. Řešitel projektu se vlastním tématem zabýval spíše okrajově a cílů projektu bylo tak dosaženo jen částečně.

Termíny řešení

  • Zahájení řešení

    1. 1. 2014

  • Ukončení řešení

    23. 4. 2018

  • Poslední stav řešení

    U - Ukončený projekt

  • Poslední uvolnění podpory

    17. 3. 2016

Dodání dat do CEP

  • Důvěrnost údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Systémové označení dodávky dat

    CEP19-GA0-GP-U/04:1

  • Datum dodání záznamu

    11. 6. 2019

Finance

  • Celkové uznané náklady

    2 278 tis. Kč

  • Výše podpory ze státního rozpočtu

    2 278 tis. Kč

  • Ostatní veřejné zdroje financování

    0 tis. Kč

  • Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

    0 tis. Kč

Základní informace

Uznané náklady

2 278 tis. Kč

Statní podpora

2 278 tis. Kč

100%


Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

CEP

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

Doba řešení

01. 01. 2014 - 23. 04. 2018