Studium proteinů kyslík vyvíjejících komplexů fotosystému II metodami molekulárního modelování a vibrační spektroskopie

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 4 (SGA02003GA2PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Proteins of oxygen evolving complexes of Photosystem II studied by means of molecular modelling

Anotace anglicky

In this project a combination of homology and energetic modelling with vibrational spectroscopy will be used for the determination of the structure of several proteins of the oxygen evolving complex bound to photosystem II of higher plants, algae and cyanobacteria. Structural and sequence alignment of the individual proteins of the oxygen evolving complex will be performed to get a basis for homology modelling. Three-dimensional models of oxygen evolving complex proteins will be suggested. During thecourse of modelling, methods of vibrational spectroscopy will be used to get more detailed information about the secondary structure content and the spatial arrangement and interactions of individual acromatic residues. These data will serve as a feedback for the generation of three-dimensional models. For the purpose of vibrational spectroscopy proteins of the oxygen evolving complex will be isolated and isolation protocols will be optimized. Thus, gained models will serve for the detection of

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - další vedlejší obor

ED - Fyziologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30105 - Physiology (including cytology)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Strukturní a sekvenční porovnání proteinů OEC dosavadních známých primárních struktur proteinů z proteinové databáze s jednotlivými proteiny OEC z různých organismů (vyšší rostliny, řasy, sinice) bylo prováděno k určení příbuznosti proteinů mezi jednotli

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-GA0-GP-U/03:2

Datum dodání záznamu

16. 10. 2007

Celkové uznané náklady

1 271 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

596 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

900 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč