Vliv superhelicity DNA na sekvenčně specifickou a strukturně selektivní vazbu proteinu p53

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 7 (SGA02004GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Influence of DNA superhelicity on sequence specific and structure selective binding of the p53 protein

Anotace anglicky

Tumor suppressor protein p53 is one of the most important regulators of cell proliferation, differentiation and programmed cell death. P53 is mutated in more than 50% of cancer cases. This project is focused towards studies of p53 - DNA interaction, which play crucial role in p53 protein function. DNA protein binding is often supercoiling dependent. We will use a new method for analysis of the effect of DNA supercoiling on p53 binding allowing detail studies of binding properties to native response elements in supercoiled DNAs. Using topoisomerase we will prepare and analyze p53 binding to sets of topoisomeric samples and compare with p53 binding to DNA at native superhelix density. We will prepare new DNA construct with local structures to study binding of the p53 protein to these structures stabilized by DNA supercoiling. The role of post-translational modification of p53 protein will be investigated. We will test DNA binding properties of p53 mutants common in human cancers.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Jednou z nejdůležitějších vlastností nádorového supresoru proteinu p53 je jeho sekvenčně specifická vazba na DNA. Zjistili jsme, pomocí kompetitivního stanovení v agarosových gelech, že p53 cílové (konsensus) sekvence v delších fragmentech DNA jsou lepší

Zahájení řešení

1. 1. 2004

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-GA0-GP-U/03:2

Datum dodání záznamu

16. 10. 2007

Celkové uznané náklady

720 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

720 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč