Regulace vazby transkripčních aktivátorů k cílovým sekvencím v superhelikální DNA. Vliv fosforylace nádorových supresorů na jejich vazebnou aktivitu

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Regulation of transcription factors binding to consensus sequences in superhelical DNA. Influence of phosphorylation of tumor supressor proteins

Anotace anglicky

We propose systematic studies of interaction of supercoiled DNA with transcription factors. In our study we wil clone natural binding sequences of p53, p73 and Smad4 proteins to plasmid vectors and analyze their accessibility in supercoiled DNA. We suppose that superhelical density of DNA can play key role in discrimination between different natural binding sequences. We will use our new method for semiquantitative testing of the effect of the DNA supercoiling on protein binding and technique of supershifting of specific protein /DNA complexes by monoclonal antibodies. The effect of specific phosphorylations of these proteins to scDNA binding (with and without consensus sequences) will be studied. A special attention will be paid to specific phosphorylations found in cancer cells. We will attempt to use in vitro gel shift analysis assay for testing DNA binding status of p53 protein isolated directly from malignant tumors.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Nádorový supresor protein p53 se váže preferenčně na cílové sekvence v superhelikální DNA. Tato vazba je regulovatelná fosforylací proteinu p53 a vazbou monoklonálních protilátek. Specifické fosforylace vedou k aktivaci vazby proteinu p53.

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2004

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2005/AV0/AV05IA/U/N/5:3

Datum dodání záznamu

26. 9. 2007

Celkové uznané náklady

3 400 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 080 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 320 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč