Studium repetitivních sekvencí u hrachu setého (Pisum sativum L.)
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Postdoktorandské granty
Veřejná soutěž
Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)
Hlavní účastníci
Ústav molekulární biologie rostlin AV ČR
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
A study of repetitive sequences in pea (Pisum sativum L.)
Anotace anglicky
A study of repetitive sequences in pea (Pisum sativum L.) The aim of this project is an isolation of full-length clones of new repetitive elements from the genome of pea (Pisum sativum L.) and their thorough analysis. These clones will be retrieved fromphage pea genomic library using probes prepared from repetitive sequences isolated during our preliminary experiments in the laboratory of my supervisor. The sequences represent the most abundant repeats in pea with copy numbers between 1000 - 10000 perhaploid genome. Molecular and cytogenetic analysis of complete sequences of these elements will provide valuable information about composition and organisation of the pea genome. In addition, monitoring of their occurrence in other Fabaceae species willincrease our knowledge about evolutionary relationships within this family. Newly isolated repetitive sequences will also be potentially applicable for genetic mapping.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
GE - Šlechtění rostlin
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Cílem projektu bylo nalézt a charakterizovat kompletní sekvence repetitivních elementů k vybraným neúplným sekvencím, které byly popsány v genomu hrachu dříve. Charakterizovali jsme dvě nové rodiny LTR retrotranspozónů. První rodina, nazvaná Ogre, má něk
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2002
Ukončení řešení
1. 1. 2004
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2005/GA0/GA05GP/U/N/A:8
Datum dodání záznamu
23. 7. 2008
Finance
Celkové uznané náklady
1 026 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
672 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
354 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč