Molekulární a cytogenetická analýza gigantických genomů rodu Fritillaria (Liliaceae)

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

521/07/0284

Název projektu anglicky

Molecular and cytogenetic analysis of the giant genomes of Fritillaria (Liliaceae)

Anotace anglicky

The genus Fritillaria includes species with the largest reported genome size for any plant. This project aims to provide molecular and cytogenetic study of the DNA sequences contributing to the genome obesity and its variation within the genus. We aim toaddress the following questions: (1) How does genome size vary within Fritillaria in a phylogenetic framework? (2) Are these giant genomes composed of a high number of different repeat families, or a few repeat types amplified to extremely high copy numbers? (3) What contribution do the different classes of repetitive DNA make to genome size variation and the striking differences in heterochromatin amounts between Fritillaria species? (4) What is the chromosomal distribution of the major families ofrepetitive elements and how is genome obesity linked with karyotype stability? (5) How is the phylogenetic relationship between different repeat families reflected in phylogenies/patterns based on nuclear/plastid genes, heterochromatin amount and genome

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu bylo úspěšné a přineslo nové a důležité poznatky o struktuře a evoluci genomu rostlin. U zástupců rodu Frittilaria s největšími známými genomy krytosemenných docházelo ke vzniku extrémní genomové obezity spíše pasívně než v důsledku sele?

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

22. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-GA0-GA-U/02:2

Datum dodání záznamu

22. 1. 2015

Celkové uznané náklady

4 122 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 122 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč