Původ, struktura a osud transkriptů repetitivních sekvencí u rostlin

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 6 (SAV02008-B)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

KJB500960802

Název projektu anglicky

Origin, structure, and destiny of transcripts derived from repetitive sequences in plants

Anotace anglicky

Repetitive sequences make up a large proportion of most eukaryotic genomes. While they have traditionally been considered genomic parasites or junk DNA, recent data showed that at least some families of repetitive sequences play significant roles in a number of biological processes, some of which are cognate to their transcription. The major objective of this project is to carry out a comprehensive analysis of transcription of various repetitive sequences in a broad spectrum of plant species. Relevant data will be acquired using bioinformatics approaches combined with molecular and cytogenetic techniques. Transcriptionally active repeats will be characterized in term of the transcripts origin and structure as well as posttranscriptional processing andultimate destiny. The obtained data will be important for deciphering potential biological roles of repetitive sequences and for our understanding of their interaction with host genomes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EA - Morfologické obory a cytologie

CEP - další vedlejší obor

ED - Fyziologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Při řešení projektu bylo prokázáno, že 1) všechny testované repetitivní sekvence jsou transkribované, ačkoli četnosti transkriptů jednotlivých typů repetic se liší a 2) že tyto transkripty jsou působením RNAi degradovány na siRNA.

Zahájení řešení

1. 1. 2008

Ukončení řešení

31. 12. 2010

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

9. 3. 2010

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP11-AV0-KJ-U/02:2

Datum dodání záznamu

14. 6. 2011

Celkové uznané náklady

1 963 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 963 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč