Mechanismus vstupu a výstupu látek do/z aktivního místa mikrosomálních cytochromů P450 při metabolizmu léčiv

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 12 (SGA02012GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P303-12-P019

Název projektu anglicky

Mechanism of ligand access/egress to/from active site of microsomal drug-metabolising cytochromes P450

Anotace anglicky

The microsomal cytochromes P450 (CYPs) are enzymes capable of metabolizing foreign substances (xenobiotics) such as drugs or pollutants during the first-pass metabolism in liver. The structure of the CYP enzyme contains buried active site connected to the surrounding environment by a network of channels serving as an access/egress paths. It is likely that these access/egress channels may determine the substrate specificity of the CYP enzymes and they also affect kinetics of CYP reactions. Despite the progress in the channel identification, many questions about the mechanism remains to be answered. One of the challenges is the explanation of the access/egress mechanism for any substrate or product. Knowledge of these processes would allow us to find a new therapeutic strategies taking into account ADMET properties of the drug. This project focuses on the analysis of the mechanism of the ligand access/egress to/from CYP enzymes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

FR - Farmakologie a lékárnická chemie

CEP - vedlejší obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - další vedlejší obor

CE - Biochemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30104 - Pharmacology and pharmacy

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byl vyvinut softwarový nástroj MOLE 2.0 ke studiu kanálů a pórů v proteinech, který byl integrován do bioinformatické databáze PDBsum. Pomocí tohoto nástroje byly analyzovány kanály v cytochromech P450. Kanály vedoucí do aktivního místa jsou u enzymů ve?

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

31. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GP-U/02:2

Datum dodání záznamu

6. 5. 2016

Celkové uznané náklady

976 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

976 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč