Fyzické mapování genomu Xenopus tropicalis.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 11 (SGA02011GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P502-11-P522

Název projektu anglicky

Physical mapping of Xenopus tropicalis genome.

Anotace anglicky

Xenopus tropicalis, one of the leading organisms in embryology, is recently used for research in functional genomics. This project proposes to finish cytogenetic localization of 26 large scaffolds from the first two hundred ones with undetermined position in X. tropicalis genetic map. Other methods will allow completion of chromosomal localization up to 500 scaffolds. The next objective of the project heads for development of fast method enabling large scale chromosomal localization of genes and BAC clones. The first approach will be lead through whole DNA amplificates from microdissected chromosomes followed by PCR or hybridization. The second way is based on preparation of mouse cell lines containing xenochromosome. X. tropicalis neomycin resistant cell population will be fused with mouse myeloma line. DNA from hybrid lines may be used as a source of sequences for subsequent analysis. The results will facilitate identification of mutated genes, enable the study of Vertebrata genome evolution and afford opportunity to finish sequencing and resequencing of X. tropicalis genome.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EA - Morfologické obory a cytologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Získané výsledky se týkají fyzického mapování genomu Xenopus tropicalis. Projekt přinesl nové informace týkající se původu a remodelace chromosome X. Dále lokalizace dosud nezmapovaných ?scaffolds? a genů. Většina cílů projektu byla splněna, Výsledky by?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GP-U/02:2

Datum dodání záznamu

6. 5. 2016

Celkové uznané náklady

2 093 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 093 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč