Nové metody pro efektivní studium a mapování genomů kulturních rostlin

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Komplexní projekty

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Novel approaches for effective analysis and mapping of genomes in cultivated plants

Anotace anglicky

This project proposes a novel and powerful approach for the efficient analysis and mapping of large eukaryotic genomes. Specifically, we propose the development of means for the construction of chromosome-specific DNA libraries, isolation of chromosome-specific DNA sequences and markers, and the development of chromosome paints for economically important cereals (Zea mays, Secale cereale, Hordeum vulgare and Triticum aestivum), legumes (Vicia faba, Pisum sativum, Medicago sativa), a coniferous tree (Picea abies), and a dioecious plant Melandrium album. The project is based on a multidisciplinary approach combining classical genetics (the use of isogenic and translocation lines) with flow cytogenetics (chromosome isolation and flow-sorting of single chromosome types), molecular techniques (DNA isolation, cloning and primed in situ DNA labelling). The ultimate goal will be to use chromosome-specific libraries, markers and paints to increase the density and accuracy of genetics

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

EI - Biotechnologie a bionika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cíl komplexního (6ti letého) projektu, vypracování a zavedení nových metod analýzy genomu byl splněn. Průtoková cytometrie a třídění chromosomů pomůže dalšímu rozvoji genomiky v ČR. Významnou součástí projektu byla výchova studentů na jednotlivých pracov

Zahájení řešení

1. 1. 1996

Ukončení řešení

1. 1. 2001

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2002/GA0/GA02GV/U/N/4:2

Datum dodání záznamu

19. 11. 2002

Celkové uznané náklady

37 935 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

26 482 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

10 486 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč